MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Neisseria meningitidis G2136 chromosome

Total Repeats: 38096

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017513	TATCCA	2	12	15	26	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385339063
2	NC_017513	CCT	2	6	178	183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385339063
3	NC_017513	CCAA	2	8	228	235	50 %	0 %	0 %	50 %	385339063
4	NC_017513	ATC	2	6	304	309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385339063
5	NC_017513	AGA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385339063
6	NC_017513	CTC	2	6	409	414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385339063
7	NC_017513	AAC	2	6	416	421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385339063
8	NC_017513	AACC	2	8	427	434	50 %	0 %	0 %	50 %	385339063
9	NC_017513	TGC	2	6	613	618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385339064
10	NC_017513	GC	3	6	673	678	0 %	0 %	50 %	50 %	385339064
11	NC_017513	GAT	2	6	703	708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385339064
12	NC_017513	TTGTT	2	10	722	731	0 %	80 %	20 %	0 %	385339064
13	NC_017513	A	6	6	807	812	100 %	0 %	0 %	0 %	385339064
14	NC_017513	T	7	7	834	840	0 %	100 %	0 %	0 %	385339064
15	NC_017513	CTT	3	9	941	949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385339065
16	NC_017513	CTT	2	6	1046	1051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385339065
17	NC_017513	GCA	2	6	1130	1135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385339065
18	NC_017513	GCG	2	6	1141	1146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385339065
19	NC_017513	GTTT	2	8	1189	1196	0 %	75 %	25 %	0 %	385339065
20	NC_017513	TCG	2	6	1216	1221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385339065
21	NC_017513	GT	3	6	1226	1231	0 %	50 %	50 %	0 %	385339065
22	NC_017513	TTC	2	6	1390	1395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385339065
23	NC_017513	TGGAGA	2	12	1410	1421	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385339065
24	NC_017513	TCAAA	2	10	1430	1439	60 %	20 %	0 %	20 %	385339065
25	NC_017513	GAA	2	6	1464	1469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385339065
26	NC_017513	TCG	2	6	1474	1479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385339065
27	NC_017513	GCCCA	2	10	1486	1495	20 %	0 %	20 %	60 %	385339065
28	NC_017513	CGC	2	6	1568	1573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385339065
29	NC_017513	T	7	7	1586	1592	0 %	100 %	0 %	0 %	385339065
30	NC_017513	ATC	2	6	1609	1614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385339065
31	NC_017513	CAGG	2	8	1631	1638	25 %	0 %	50 %	25 %	385339065
32	NC_017513	GTT	2	6	1680	1685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385339065
33	NC_017513	GTC	2	6	1692	1697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385339065
34	NC_017513	GTC	2	6	1731	1736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385339065
35	NC_017513	GTC	2	6	1791	1796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385339065
36	NC_017513	GAC	2	6	1878	1883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385339065
37	NC_017513	GCC	2	6	1931	1936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385339065
38	NC_017513	GCG	2	6	1938	1943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385339065
39	NC_017513	CTT	2	6	1961	1966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385339065
40	NC_017513	CTT	2	6	1997	2002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385339065
41	NC_017513	TGC	2	6	2003	2008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385339065
42	NC_017513	AGT	2	6	2015	2020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385339065
43	NC_017513	CTT	2	6	2054	2059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385339065
44	NC_017513	CGG	2	6	2074	2079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385339065
45	NC_017513	ACG	2	6	2089	2094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385339065
46	NC_017513	GAT	2	6	2142	2147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385339065
47	NC_017513	GC	3	6	2169	2174	0 %	0 %	50 %	50 %	385339065
48	NC_017513	ATG	2	6	2214	2219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385339065
49	NC_017513	CGC	2	6	2255	2260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385339065
50	NC_017513	ATG	2	6	2311	2316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385339065
51	NC_017513	GCA	2	6	2502	2507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385339066
52	NC_017513	T	7	7	2514	2520	0 %	100 %	0 %	0 %	385339066
53	NC_017513	TCC	2	6	2582	2587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385339066
54	NC_017513	CCG	2	6	2595	2600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385339066
55	NC_017513	CAC	2	6	2632	2637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385339066
56	NC_017513	CGGA	2	8	2665	2672	25 %	0 %	50 %	25 %	385339066
57	NC_017513	TGT	2	6	2673	2678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385339066
58	NC_017513	GC	3	6	2725	2730	0 %	0 %	50 %	50 %	385339066
59	NC_017513	CCG	2	6	2755	2760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385339066
60	NC_017513	T	6	6	2788	2793	0 %	100 %	0 %	0 %	385339066
61	NC_017513	GCG	2	6	2900	2905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385339066
62	NC_017513	CGG	2	6	2941	2946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385339066
63	NC_017513	GCCC	2	8	2955	2962	0 %	0 %	25 %	75 %	385339066
64	NC_017513	GCC	2	6	3121	3126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385339067
65	NC_017513	GAT	2	6	3167	3172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385339067
66	NC_017513	GCA	2	6	3185	3190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385339067
67	NC_017513	ATC	2	6	3240	3245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385339067
68	NC_017513	CAT	2	6	3255	3260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385339067
69	NC_017513	CG	3	6	3263	3268	0 %	0 %	50 %	50 %	385339067
70	NC_017513	TTG	2	6	3286	3291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385339067
71	NC_017513	GCG	2	6	3320	3325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385339067
72	NC_017513	GCA	2	6	3349	3354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385339067
73	NC_017513	TTC	2	6	3363	3368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385339067
74	NC_017513	GGC	2	6	3381	3386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385339067
75	NC_017513	TGC	2	6	3395	3400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385339067
76	NC_017513	GACAT	2	10	3430	3439	40 %	20 %	20 %	20 %	385339067
77	NC_017513	TGCC	2	8	3736	3743	0 %	25 %	25 %	50 %	385339068
78	NC_017513	A	6	6	3768	3773	100 %	0 %	0 %	0 %	385339068
79	NC_017513	CGT	2	6	3935	3940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385339068
80	NC_017513	A	6	6	3991	3996	100 %	0 %	0 %	0 %	385339068
81	NC_017513	CGG	2	6	4271	4276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385339069
82	NC_017513	CAA	2	6	4310	4315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385339069
83	NC_017513	ACCAA	2	10	4389	4398	60 %	0 %	0 %	40 %	385339069
84	NC_017513	CCG	2	6	4563	4568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385339069
85	NC_017513	CGG	2	6	4652	4657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385339069
86	NC_017513	AAC	3	9	4660	4668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385339069
87	NC_017513	CGT	2	6	4688	4693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385339069
88	NC_017513	CTG	2	6	4707	4712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385339069
89	NC_017513	CGA	2	6	4718	4723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385339069
90	NC_017513	AAC	2	6	4796	4801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385339069
91	NC_017513	TCG	2	6	4807	4812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385339069
92	NC_017513	GAC	2	6	4873	4878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385339069
93	NC_017513	CAT	2	6	4888	4893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385339070
94	NC_017513	CG	3	6	4921	4926	0 %	0 %	50 %	50 %	385339070
95	NC_017513	CGC	2	6	5067	5072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385339070
96	NC_017513	CCG	3	9	5094	5102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385339070
97	NC_017513	CTG	2	6	5132	5137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385339070
98	NC_017513	GC	3	6	5138	5143	0 %	0 %	50 %	50 %	385339070
99	NC_017513	ACA	2	6	5157	5162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385339070
100	NC_017513	AGA	2	6	5179	5184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385339070
101	NC_017513	GAA	2	6	5192	5197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385339070
102	NC_017513	CGCC	2	8	5289	5296	0 %	0 %	25 %	75 %	385339070
103	NC_017513	TTTC	2	8	5417	5424	0 %	75 %	0 %	25 %	385339070
104	NC_017513	AGA	2	6	5494	5499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385339070
105	NC_017513	GC	3	6	5523	5528	0 %	0 %	50 %	50 %	385339070
106	NC_017513	CGT	2	6	5532	5537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385339070
107	NC_017513	CCG	2	6	5542	5547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385339070
108	NC_017513	CCTT	2	8	5550	5557	0 %	50 %	0 %	50 %	385339070
109	NC_017513	CCG	3	9	5586	5594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385339070
110	NC_017513	GCT	2	6	5617	5622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385339070
111	NC_017513	CT	3	6	5621	5626	0 %	50 %	0 %	50 %	385339070
112	NC_017513	GAA	2	6	5699	5704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385339070
113	NC_017513	CCA	2	6	5760	5765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385339070
114	NC_017513	A	6	6	5792	5797	100 %	0 %	0 %	0 %	385339070
115	NC_017513	T	6	6	5973	5978	0 %	100 %	0 %	0 %	385339071
116	NC_017513	TCA	2	6	5992	5997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385339071
117	NC_017513	AAGGC	2	10	6005	6014	40 %	0 %	40 %	20 %	385339071
118	NC_017513	CG	3	6	6021	6026	0 %	0 %	50 %	50 %	385339071
119	NC_017513	GCAC	2	8	6078	6085	25 %	0 %	25 %	50 %	385339071
120	NC_017513	GCC	2	6	6100	6105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385339071
121	NC_017513	CGG	2	6	6110	6115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385339071
122	NC_017513	AAT	2	6	6134	6139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385339071
123	NC_017513	CGC	2	6	6210	6215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385339072
124	NC_017513	GGCA	2	8	6235	6242	25 %	0 %	50 %	25 %	385339072
125	NC_017513	CCG	2	6	6278	6283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385339072
126	NC_017513	CGC	2	6	6328	6333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385339072
127	NC_017513	TGCTT	2	10	6364	6373	0 %	60 %	20 %	20 %	385339072
128	NC_017513	GCC	2	6	6403	6408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385339072
129	NC_017513	TCAAAC	2	12	6419	6430	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385339072
130	NC_017513	CGG	3	9	6489	6497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385339072
131	NC_017513	CGG	2	6	6570	6575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385339072
132	NC_017513	ACG	2	6	6590	6595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385339072
133	NC_017513	TCGG	2	8	6599	6606	0 %	25 %	50 %	25 %	385339072
134	NC_017513	GCC	2	6	6629	6634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385339072
135	NC_017513	T	7	7	6648	6654	0 %	100 %	0 %	0 %	385339072
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261	NC_017513	CAA	2	6	13088	13093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385339077
262	NC_017513	GTT	2	6	13102	13107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385339077
263	NC_017513	GTC	2	6	13115	13120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385339077
264	NC_017513	ACC	2	6	13122	13127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385339077
265	NC_017513	CAT	3	9	13142	13150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385339077
266	NC_017513	ATA	2	6	14776	14781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385339078
267	NC_017513	ATG	2	6	14804	14809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385339078
268	NC_017513	T	6	6	14842	14847	0 %	100 %	0 %	0 %	385339078
269	NC_017513	ATT	2	6	14851	14856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385339078
270	NC_017513	GGGC	2	8	14895	14902	0 %	0 %	75 %	25 %	385339078
271	NC_017513	ATG	2	6	14981	14986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385339078
272	NC_017513	GTTT	2	8	15125	15132	0 %	75 %	25 %	0 %	385339078
273	NC_017513	T	6	6	15130	15135	0 %	100 %	0 %	0 %	385339078
274	NC_017513	TATC	2	8	15186	15193	25 %	50 %	0 %	25 %	385339078
275	NC_017513	ATGT	2	8	15202	15209	25 %	50 %	25 %	0 %	385339078
276	NC_017513	TCT	2	6	15221	15226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385339078
277	NC_017513	CTG	2	6	15259	15264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385339078
278	NC_017513	TAA	2	6	15444	15449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385339078
279	NC_017513	TAG	2	6	15461	15466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385339078
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281	NC_017513	CTG	2	6	15480	15485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385339078
282	NC_017513	CAT	3	9	15576	15584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385339078
283	NC_017513	TAATG	2	10	15597	15606	40 %	40 %	20 %	0 %	385339078
284	NC_017513	GTTT	2	8	15616	15623	0 %	75 %	25 %	0 %	385339078
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290	NC_017513	TTTC	2	8	16123	16130	0 %	75 %	0 %	25 %	385339079
291	NC_017513	TTC	2	6	16168	16173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385339079
292	NC_017513	TA	3	6	16193	16198	50 %	50 %	0 %	0 %	385339079
293	NC_017513	GCTT	2	8	16237	16244	0 %	50 %	25 %	25 %	385339079
294	NC_017513	AACA	2	8	16268	16275	75 %	0 %	0 %	25 %	385339079
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298	NC_017513	TTC	2	6	16373	16378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385339079
299	NC_017513	T	7	7	16382	16388	0 %	100 %	0 %	0 %	385339079
300	NC_017513	ACT	2	6	16394	16399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385339079
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302	NC_017513	T	6	6	16529	16534	0 %	100 %	0 %	0 %	385339079
303	NC_017513	AT	3	6	16711	16716	50 %	50 %	0 %	0 %	385339079
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307	NC_017513	ATTT	2	8	17079	17086	25 %	75 %	0 %	0 %	385339079
308	NC_017513	CAAG	2	8	17717	17724	50 %	0 %	25 %	25 %	385339080
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341	NC_017513	CTG	2	6	20521	20526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385339083
342	NC_017513	ATAA	2	8	20570	20577	75 %	25 %	0 %	0 %	385339083
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353	NC_017513	TCA	2	6	21101	21106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385339085
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382	NC_017513	ATTTC	2	10	25052	25061	20 %	60 %	0 %	20 %	385339087
383	NC_017513	ACG	2	6	25069	25074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385339087
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388	NC_017513	T	6	6	25474	25479	0 %	100 %	0 %	0 %	385339088
389	NC_017513	GTT	2	6	25492	25497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385339088
390	NC_017513	CGC	2	6	25500	25505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385339088
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392	NC_017513	CAT	2	6	25602	25607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385339088
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